Montpellier Genomic Collection

ARPEGE

Présentation de la plateforme et de ses plateaux

MGC : Présentation

La plateforme Montpellier Genomic Collections (MGC) créée en 2009 est composée de deux plateaux : un plateau ayant comme activité principale le clonage et le criblage à moyen débit et un autre plateau de génotypage à haut débit (GénObi) .

Le plateau de « clonage/criblage » a pour objectif d’utiliser des technologies de clonage à haut débit pour fournir aux utilisateurs les vecteurs de leur choix sans avoir à les construire eux-mêmes.

La plateforme utilise la technologie de clonage Gateway, basée sur des réactions de recombinaison spécifiques au site dérivées du bactériophage lambda. Cette méthode permet la recombinaison directionnelle de deux fragments d’ADN de sites Att porteurs, et elle est utilisée ici comme méthode de clonage à haut débit.

Les clones de l’ORFeome (vecteurs d’entrée) sont recombinés avec une variété de vecteurs de destination portant un large choix d’étiquettes, et adaptés pour exprimer l’ORF dans l’organisme d’intérêt (de E. Coli aux mammifères).

Nos plateaux

Plateau : Clonage / Criblage

Le plateau Clonage / Criblage gère plusieurs banques d’ORFeomes et utilise la technologie Gateway pour créer des clones avec des tags en 3′ ou 5′ de l’ORF d’intérêt. Il propose des services de clonage, de transfert d’ORF entre vecteurs, ainsi que des prestations automatisées pour la purification d’ADN et l’analyse d’échantillons.

Plateau : GénObi

Le plateau GénObi a été créé en 2019 afin de répondre aux besoins des structures d’élevage et des utilisateurs en proposant de réaliser le génotypage des lignées murines à partir de tissus. Il est ouvert à toute la communauté scientifique montpelliéraine. Le génotypage se fait par PCR classique à haut débit s’appuyant sur un robot distributeur « tecan evo 200 » et une électrophorèse capillaire « LabChips GX Touch HT ».

Notre équipe

L’équipe de la plateforme MGC est composée de chercheurs et d’ingénieurs spécialisés en biologie moléculaire et en génomique. Grâce à notre expertise et à nos équipements de pointe, nous accompagnons les utilisateurs à chaque étape de leurs projets, de la conception expérimentale à l’analyse des résultats.

Équipe MGC

Plateau : Clonage / Criblage

La plateforme gère 4 banques d’ORFeome humain, un ORFeome souris et un ORFeome de levure. Le système de clonage Gateway permet ainsi d’ajouter un tag en 3’ ou 5’ de l’ORF d’intérêt. La plateforme gère et enrichit une banque de vecteurs de destination compatible avec le système de clonage Gateway.

Nos prestations consistent à sortir des clones, créer de nouveaux clones dans des vecteurs pDON et transférer les ORF dans différents vecteurs de destinations.

Clonage :

MGC distribue également des guides individuels CRISPR /Cas9 de la banque Sanger.

Cette technique permet d’étudier l’expression de molécules individuelles d’ARN dans les cellules. MGC distribue des sondes SmFISH sous forme ARN pour la détection de molécules unique d’ARN.

Automatisation / Robotisation :

Un robot QiaCube est mis à la disposition des utilisateurs pour la purification d’ADN plasmidique. L’ensemble du consommable et du kit de purification sont disponibles au magasin de l’IGMM. Après une formation d’une demi-heure, vous pourrez utiliser le robot en toute autonomie après réservation.

MGC propose l’analyse d’échantillons ADN ou ARN par électrophorèse capillaire (LabChip GX Touch HT). Cet appareil permet l’analyse en tube PCR, plaques 96 et plaque 384 puits.

Un robot de pipetage de type Tecan Evo 200 muni de 8 aiguilles et 8 portes cônes, un système à vide (permettant les purifications sur colonnes en format 96 puits), 2 agitateurs chauffants et 2 bloques chauffants.

MGC vous propose de robotiser vos protocoles à la carte.

Plateau : GénObi

Plateau de Génotypage haut (O) débit

Le plateau GénObi est rattaché à la plateforme MGC. Il est situé sur le campus CNRS de la route de Mende.

GénObi propose un service de génotypage essentiellement murins pour la communauté scientifique Montpelliéraine. En effet, ce plateau a pour vocation de supporter les équipes de recherche en prenant en charge leur génotypage qui reste une étape chronophage, cruciale et indispensable dans les projets scientifiques.

Le plateau a mis en place une procédure de génotypage à haut débit par PCR classique en simple ou multiplexée tout en assurant la fiabilité et la qualité des résultats rendus.

Afin de faciliter l’acheminement des biopsies directement entre les structures d’élevage et GénObi, une navette RHEM gérée par l’INSERM a été mise en place permettant de faire cette collecte.

MGC : Organigramme

Direction de la plateforme MGC

    Responsable Scientifique :

  • Edouard BERTRAND
    • (DR, CNRS, 5%)

    Responsable opérationnel :

  • Frederic LIONNETON
    • (IR, CNRS, 10%)
+-

Comité de Direction

  • Edouard BERTRAND
  • Frederic LIONNETON
  • Céline SALSAC
+-

Comité d'orientation scientifique et technique

    Experts locaux :

  • Anna CASTRO
    • (CRBM, Montpellier)
  • Virginie DELEUZE
    • (IGMM, Montpellier)
  • Raphael GAUDIN
    • (IRIM, Montpellier)
  • Denis GREUET
    • (INM, Montpellier)
  • Pierre-François MERY
    • (IGF, Montpellier)
  • Geneviève RODIER
    • (IRCM, Montpellier)
  • Jeanne STER
    • (IGF, Montpellier)
  • Anne SUTTER
    • (BCM, Montpellier)
+-

Plateau clonages

    Responsable Technique :

  • Frederic LIONNETON (IR, CNRS, 90%)

    Personnel plateau permanent :

  • Marie-Cecile ROBERT (IE, CNRS, 25%)
+-

Plateau GenObi

    Responsable Technique :

  • Céline SALSAC (AI, CNRS, 70%)

    Personnel plateau permanent :

  • Sarah COUDERC (T, CNRS, 100%)
+-

MGC : Pour toute demande, contactez nous !

Coordonnées Téléphoniques : Plateau Clonage/Criblage

Frederic Lionneton – Responsable opérationnel

Christelle Anguille – Personnel plateau

Tel : 04 34 35 97 19

Coordonnées Téléphoniques : Plateau GénObi

Frederic Lionneton – Responsable opérationnel

Céline Salsac – Responsable Technique

Sarah Couderc - Personnel plateau

Tel : 04 34 35 95 62