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Liste des Équipements & Technologies de la plateforme MGC

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Banques biologiques

Version 5.1 (hORFeome Database)

  • Vecteur : pDON223 (résistant à la spectinomycine)
  • Caractéristiques :
    • Pas de codon stop
    • Présentée sous forme de pool de clones (et non en clone unique)
    • Non séquencée initialement, mais les clones sont re-isolés et partiellement séquencés par la plateforme
  • Contenu :
    • 15 483 ORF humaines
    • 12 794 gènes humains non redondants
  • Remarque : Environ 20 % des clones de cette version contiennent des erreurs (délétions/mutations).

Version 8.1 (hORFeome Database)

  • Vecteur : pDON223 (résistant à la spectinomycine)
  • Caractéristiques :
    • Pas de codon stop
    • Clones uniques et séquencés
  • Contenu :
    • 12 230 clones humains
    • 11 149 ORF non redondants
  • Avantage : Beaucoup moins d’erreurs que la version 5.1.

Version 9

  • Contenu : 17 550 clones humains
  • Disponibilité : Liste des clones disponible.
  • Avantage : ORFeome entièrement séquencé.

Comparaison et Recommandations

  • Il est préférable d’utiliser les versions 8.1 ou 9, car elles sont entièrement séquencées et présentent moins d’erreurs que la version 5.1.

Version Life Technologies

  • Vecteur : pDON221 (résistant à la kanamycine)
  • Caractéristiques : Présence de codons stop
  • Contenu : 17 434 clones humains avec codon stop

ORFeome de Biovalley. Les ORF sont dans des pDON223 (Spectinomycine resistant). Certains clones possèdent un codon stop d’autres non. Il possède 2114 clones.

Les ORF sont dans des BG1805 (Ampicilline resistant). Cet ORFeome contient 4900 ORF.

Nous avons une banque de vecteurs d’expression permettant d’exprimer le gène d’intérêt sous contrôles de promoteurs plus ou moins fort et de réaliser des fusions en N et C-terminal avec des clones fluorescents ou non fluorescents.

Plaque de culture